Attualmente, marzo 2020, il patrimonio librario della Biblioteca è costituito da oltre 60.000 volumi provenienti per gran parte dalle collezioni ex CIDiS di ambito biomedico, scientifico e tecnologico.
Ne fanno parte anche le collezioni di ambito medico-farmacologico dell'ex Biblioteca di Farmacologia e Medicina Sperimentale e quelle di ambito farmaceutico e delle neuroscienze dell'ex Biblioteca di Scienze del Farmaco.

Nell'Opac di ateneo il patrimonio della biblioteca risulta suddiviso nelle seguenti collocazioni e denominazioni:

• Biomedica Città Studi. Diritto allo studio (volumi disponibili al prestito)
• Biomedica Città Studi (volumi disponibili al prestito o alla sola consultazione)
• Biomedica Città Studi. Scienze del farmaco (per prestito o consultazione scrivere a: biblioteca.biomedica@unimi.it)
• Biomedica Citta Studi. Magazzino (volumi non disponibili nè al prestito nè alla consultazione)

Nella sezione Diritto allo studio sono presenti volumi in copie multiple non collocate per disciplina: per ottenere i volumi in prestito si raccomanda agli utenti di accedere allo spazio personale dell'Opac inserendo la richiesta di prestito e avendo cura di annotare la collocazione dei volumi.
E' inoltre presente una postazione per l'autoprestito a cui si accede con il badge di ateneo.